合成珍珠與天然珍珠主要有形狀、結構、顏色三方面的區別：

形狀不同：天然珠(海珠)因核中異常不滾因，故外形圓度差;養珠，一般核較圓，故成珠后，常有精圓珠。

結構不同：養珠的內核是人工制作的;天然珠的內核是天然的石英砂粒或其它物質。珍珠無核，表里如一，珠身緊密、細膩、滋潤，近似半透明，實際為不透明;養珠有核，表里不一，皮落不光滑，有巢皮，珠身結構較松。

顏色不同：天然珠(海珠)質地細膩，光澤柔和，透明度高(多為半透明);養珠因成珠年代短，質地松散，光澤不強，表面常有“小包”俗稱“廉子包”或“揪”。