1、概念不同：老三板主要是解決從主板退市的股票；新三板是全國性的非上市股份有限公司股權交易平臺，主要針對的是中小微型企業，目前新三板分為基礎層和創新層。

2、交易規則不同：老三板漲跌幅限制為5%，老三板股票凈資產為負的公司每周一三五交易；凈資產為正的公司一周交易5次；不能按時披露年報的公司只能周五交易一次；新三板創新層漲跌幅限制為50%，新三板基礎層漲跌幅限制為100%，沒有交易次數限制。

3、股票代碼不同：老三板代碼以40開頭；而新三板代碼以43、87和83開頭。