南通公積金管理中心于2002年1月24日在江蘇南通濠北路8號蘇通大廈注冊成立，主要經營住房基金管理等，注冊員工人數為78人，注冊資本263萬元人民幣，公司聯系電話為0513-5193177。

南通市住房公積金管理中心為南通市***直屬的副處級事業單位，承擔著全市行政區域內住房公積金管理運作的職能。中心積極關注民生，持續推進為民服務的“零距離”滿意工程，不斷加強和改善公積金管理，積極推進管理創新。多年來，中心為提高南通職工的購房能力，為充分發揮住房公積金的金融支撐作用，構建和諧南通，早日實現住房小康作出了重要的貢獻。

南通市住房公積金管理中心內設綜合科、政策信息科、歸集管理科科、資金運作科（資產保全科）、會計核算科、財務審計科，以及海安、如皋、如東、通州、海門、啟東、六個經辦網點和市經濟技術開發區辦事處。至2007年底，在編人員84名，其中研究生學歷2名，在讀研究生1名，大學本科38名，大學專科34名，大學專科以上學歷人員占到89.29%；高級職稱3名，中級職稱26名，中級職稱以上人員占34.52%。

截至2007年底，中心已為全市8915個單位的48.96萬名職工建立了住房公積金制度，覆蓋率達89.05%；累計歸集97.68億元，余額51.97億元，分別突破90億元和50億元大關；向全市9.54萬戶家庭累計發放93.70億元住房公積金貸款，突破90億元大關；貸款余額占全市住房貸款余額101.75億元的32.77%。

至2007年底，南通公積金管理中心連續六年榮獲了江蘇省、南通市“文明單位”稱號，還獲得了“省青年文明號”、“市青年文明號”、“江蘇省一級（一星）檔案工作達標單位”、“全市檔案工作出色的/卓越的/優異的/杰出的集體”等稱號。