發票專用章如果是因為首次加蓋不清楚，而造成蓋了兩次，是可以使用的。按照通用規定來說，開具的發票需要盡量做到按照規定的欄目、順序、時間限制等，全部發票聯都一次性如實加蓋印章。但是當出現加蓋不清楚的情況時，重復加蓋發票專用章，依然是有效的。

發票蓋章的相關規定

發票聯和抵扣聯都是需要加蓋發票專用章的。單位和個人在開具發票的時候，都需要按照編碼順序依次開具，填寫相關項目，字跡清楚，內容屬實，全部聯次需要綁定一次打印，內容保持對應一致。而電子發票上已經具備了稅控簽名與企業的電子簽章，因此電子發票打印出來之后，不需要再另外加蓋發票專用章了。專用發票的記賬聯是不需要加蓋發票專用章的，同時也不需要加蓋財務專用章，只需填寫與實際交易情況相符的項目明細即可。